กลุ่ม A
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 บียาร์เรอัล 6 3 2 1 4 11
2 โลโคโมทีฟ อัสตานา 6 3 1 2 3 10
3 สลาเวีย ปราก 6 2 2 2 0 8
4 มัคคาบี้เทลอาวีฟ 6 1 1 4 -7 4
กลุ่ม B
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 ดินาโม เคียฟ 6 4 1 1 6 13
2 ปาร์ติซาน เบลเกรด 6 2 2 2 -1 8
3 ยัง บอยส์ 6 1 3 2 -1 6
4 สเกนเดอร์บู กอร์ซ 6 1 2 3 -4 5
กลุ่ม C
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 สปอร์ติ้ง บราก้า 6 3 1 2 1 10
2 โดโกเรต์ส รัซกราด 6 2 3 1 2 9
3 อิสตันบูล บูยูคเซ็ค 6 2 2 2 -1 8
4 ทีเอสจี ฮอฟเฟนไฮม์ 6 1 2 3 -2 5
กลุ่ม D
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 เอซี มิลาน 6 3 2 1 7 11
2 เออีเค เอเธนส์ 6 1 5 0 1 8
3 ริเยก้า 6 2 1 3 -1 7
4 ออสเตรียเวียนนา 6 1 2 3 -7 5
กลุ่ม E
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 อตาลันต้า 6 4 2 0 10 14
2 โอลิมปิก ลียง 6 3 2 1 7 11
3 เอฟเวอร์ตัน 6 1 1 4 -8 4
4 อปอลลอน ลิมาสซอล เอฟซี 6 0 3 3 -9 3
กลุ่ม F
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 โลโคโมทีฟ มอสโก 6 3 2 1 5 11
2 เอฟซี โคเปนเฮเก้น 6 2 3 1 4 9
3 เชอร์ริฟ ติราสโพล 6 2 3 1 0 9
4 ฟาสตาฟ ซลิน 6 0 2 4 -9 2
กลุ่ม G
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 เอฟซี วิคตอเรีย พัลเซ่น 6 4 0 2 5 12
2 สเตอัว บูคาเรสต์ 6 3 1 2 2 10
3 ลูกาโน 6 3 0 3 -2 9
4 ฮาโปเอล เบียร์ เชว่า 6 1 1 4 -5 4
กลุ่ม H
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 อาร์เซน่อล 6 4 1 1 10 13
2 เซอร์เวน่า ซเวซด้า 6 2 3 1 1 9
3 โคโลญจน์ 6 2 0 4 -1 6
4 บาเต้ โบริซอฟ 6 1 2 3 -10 5
กลุ่ม I
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 เร้ดบูลล์ ซัลซ์บวร์ก 6 3 3 0 6 12
2 โอลิมปิก มาร์กเซย 6 2 2 2 0 8
3 คอนยาสปอร์ 6 1 3 2 -2 6
4 วิตอเรีย กิมาไรส์ 6 1 2 3 -4 5
กลุ่ม J
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 แอธเลติก บิลเบา 6 3 2 1 3 11
2 ออสเตอร์ซุนด์เอฟเค 6 3 2 1 4 11
3 ซอร์ย่า ลูแฮงส์ 6 2 0 4 -6 6
4 แฮร์ธ่า เบอร์ลิน 6 1 2 3 -1 5
กลุ่ม K
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 ลาซิโอ 6 4 1 1 5 13
2 นีซ 6 3 0 3 5 9
3 ซูลเต้ วาเรเกม 6 2 1 3 -5 7
4 วิเทสส์ อาร์นเฮม 6 1 2 3 -5 5
กลุ่ม L
อันดับ ทีม นัด ชนะ เสมอ แพ้ +/- แต้ม
1 เซนิต เซนต์ ปีเตอร์สเบิร์ก 6 5 1 0 12 16
2 เรอัล โซเซียดาด 6 4 0 2 10 12
3 โรเซนบอร์ก 6 1 2 3 -5 5
4 เอฟซี วาร์ดาร์ สค็อบเย่ 6 0 1 5 -17 1
ทีมที่มาร์คด้วยสีแดงได้รับการรับรองให้ผ่านเข้ารอบเรียบร้อยแล้ว